iOS 6になって、連絡先アプリに登録している情報が辞書として使えなくなってしまった件、対処方法がわかりました。
二点ありまして、一点目は巷で言われているように「設定」→「一般」→「キーボード」→「自動修正：オン」にすること。
二点目は連絡先に登録する際、「姓」と「姓のよみ」の方に登録することです。
二点目がトラップでして、これまではずっと「名」と「名のよみ」の方に（なぜか）登録していました。これでずっと問題なかったのですけど・・・。
いずれしても、対処方法が分かって良かったですo(^▽^)o
iOS 6で連絡先アプリを辞書として使用する方法 #iPhoneJP
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下記に図示されていますように、姓と名の両方に入力する必要があります。
http://blog.livedoor.jp/maohno/archives/51894591.html
>飛行機嫌いさん
すみませんお返事遅くなりました。ウチも両方入れてます。姓を入れる際にあえて名の方を消しませんでした。それが功を奏してうまくいったんですね！